完成岛屿主线剧情后，隐藏剧情的触发通常需要满足特定条件或探索特定地点。在口袋妖怪系列游戏中，隐藏剧情往往与特殊NPC、特定道具或时间条件相关。在口袋妖怪：圣灰中，完成八个道馆后需从常磐市向左进入22号道路的右侧草丛，会触发斋藏剧情。该剧情要求玩家击败斋藏并帮助他从火箭队夺回徽章，最终归还徽章才能完成整个隐藏剧情流程。
部分隐藏剧情需要玩家收集特定道具或完成前置任务。在口袋妖怪心金魂银中，雪拉比穿越时空的剧情需要携带官方配信的雪拉比前往桐树林的祠堂，并将其排在队伍首位。调查祠堂后，主角会穿越到三年前与劲敌的父亲对话，随后与坂木对战。这类隐藏剧情通常与游戏世界观的核心设定相关，且需要玩家主动探索而非被动触发。
隐藏剧情还可能分布在特殊地点或建筑中。口袋妖怪奇幻旅程的二周目内容中，玩家需在创始村下方海域找到水君，或在龙之都的观龙塔顶部使用闪光技能召唤凤凰。这些地点通常没有明确提示，需玩家通过对话线索或环境互动发现。部分隐藏剧情与时间系统绑定，如星露谷物语的海妖剧情需在冬季前往巴士站点触发NPC事件，获得放大镜后才能继续收集隐藏道具。
隐藏剧情的完成可能涉及多阶段任务或战斗挑战。在口袋妖怪釉色数码2.3版本中，玩家需在特定NPC处接取任务，并通过战斗或解谜推进剧情。在幽灵塔中需反复击败真·鬼斯并装备哀思铃才能解锁后续内容。这类设计增加了隐藏剧情的深度，但同时也要求玩家对游戏机制有较全面的了解。
触发隐藏剧情的关键在于细致探索和条件达成。玩家需结合地图线索、NPC对话及道具收集，逐步解锁游戏中的隐藏内容。
