在击败肉山后，游戏将进入困难模式，首要任务是使用肉山掉落的神锤敲碎腐化或猩红祭坛。每摧毁一个祭坛，世界会生成三种新矿石：钴矿/钯金矿、秘银矿/山铜矿、精金矿/钛金矿。这些矿石是制作强力装备的基础，优先挖掘并合成对应等级的镐子和防具套装。钛金套或精金套能显著提升生存能力，为后续挑战机械三王（双子魔眼、毁灭者、机械骷髅王）奠定基础。
提升战斗力的另一关键是通过钓鱼或探索获取特殊资源。肉山后神圣与腐化/猩红地下区域会生成光明之魂与黑暗之魂，用于制作代达罗斯风暴弓、玛瑙散弹枪等高强度武器。雪地环境中的冰雪巨人会掉落寒霜核，可合成寒霜套装增强输出。若遇到海盗入侵事件，务必参与并获取海盗弯刀或水手装备，这些物品在过渡期性价比极高。
战士需专注近战武器与防御饰品，如泰坦手套、血肉指关节；法师依赖魔力花、磁花等回蓝装备，并优先获取水晶蛇、流星法杖等魔法武器；射手则需搭配鲨鱼枪、叶绿箭等远程装备，配合游侠徽章提升暴击。盗贼虽输出略逊，但隐身机制在特定战斗中具有战略价值。根据职业特性合理搭配饰品和药水（如铁皮、耐力药剂）能最大化战斗效率。
环境改造与NPC配置同样影响实力提升。将部分地下区域转化为神圣环境可刷取独角兽坐骑与光明之魂；丛林保留未腐化区域以获取叶绿矿，并建造蘑菇生物群落房屋吸引蘑菇人NPC购买叶之翼。地牢新增的拜月教徒和星旋柱事件需谨慎应对，但其掉落的星云碎片与星尘龙法杖是毕业装备的重要组件。
最终阶段需系统性挑战世纪之花、石巨人及月亮领主。世纪之花要求玩家在丛林搭建多层平台并利用穿透性武器（如巨兽鲨配叶绿弹）；石巨人战需破坏其双臂后集中攻击头部；月亮领主则需预铺铁轨或利用护士回血机制。全程保持装备迭代（如甲虫套、星云套）与饰品优化（如天界壳、毁灭者徽章），逐步完成从过渡期到毕业的进阶。
